WEKO3
アイテム
Chromosome-scale whole genome assembly and annotation of the Jamaican field cricket Gryllus assimilis
http://hdl.handle.net/10083/0002005371
http://hdl.handle.net/10083/00020053719eac8139-9ace-4d6d-b5fb-db8cce4b9f47
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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s41597-025-05197-0.pdf (11.0 MB)
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.png)
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| Item type | アイテムタイプ（フル）(1) | |||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2025-06-11 | |||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||
| タイトル | Chromosome-scale whole genome assembly and annotation of the Jamaican field cricket Gryllus assimilis | |||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||
| 作成者 |
Yuki Ito
× Yuki Ito
× Ryuto Sanno
× Seiya Ashikari
× Kei Yura
× Toru Asahi
× Guillem Ylla
× Kosuke Kataoka
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| アクセス権 | ||||||||||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||||||||||||||
| 権利情報 | ||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||
| 権利情報 | © 2025 by the authors | |||||||||||||||||||
| 権利情報 | ||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||
| 権利情報Resource | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |||||||||||||||||||
| 権利情報 | This article is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License. | |||||||||||||||||||
| 内容記述 | ||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||
| 内容記述 | Gryllus assimilis, commonly known as Jamaican field cricket, is an edible insect with significant economic value in sustainable food production. Despite its importance, a high-quality reference genome of G. assimilis has not yet been published. Here, we report a chromosome-level reference genome of G. assimilis based on Oxford Nanopore Technologies (ONT) sequencing, Illumina sequencing, and Hi-C technologies. The assembled genome has a total length of 1.60 Gbp with a scaffold N50 of 102 Mbp, and 96.80% of the nucleotides was assigned to 15 chromosome-scale scaffolds. The assembly completeness was validated using BUSCO, achieving 99.5% completeness against the arthropoda database. We predicted 27,645 protein-coding genes, and 825 Mb repetitive elements were annotated in the reference genome. This reference genome of G. assimilis can provide a basis for the subsequent development of genomic resources, offering insights for future functional genomic studies, comparative genomics, and DNA-informed breeding of this species. | |||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||
| 出版者 | Springer-Nature | |||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||
| 日付 | ||||||||||||||||||||
| 日付 | 2025-05 | |||||||||||||||||||
| 日付タイプ | Issued | |||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||
| 関連情報 | ||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.1038/s41597-025-05197-0 | |||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | ||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 2052-4463 | |||||||||||||||||||
| 収録物名 | ||||||||||||||||||||
| 収録物名 | Scientific Data | |||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||
| 巻 | ||||||||||||||||||||
| 巻 | 12 | |||||||||||||||||||
| 開始ページ | ||||||||||||||||||||
| 開始ページ | 826 | |||||||||||||||||||
